東南亞的一種泥蛇，Enhydris enhydris。泥蛇署名:uux.cn/Kenneth Chin
（神秘的研究亞神深圳福田區(qū)上門（上門一條龍服務(wù)）[微信1662+044-1662][提供外圍女上門服務(wù)快速安排面到付款不收定金地球uux.cn）據(jù)堪薩斯大學(xué)：堪薩斯大學(xué)對東南亞一群不為人知但獨特的“泥蛇”進(jìn)行了一項新的基因組調(diào)查，改寫了這個名為Homalopsidae的東南家族的進(jìn)化史。這些結(jié)果剛剛發(fā)表在《系統(tǒng)生物學(xué)家協(xié)會公報》上。秘蛇秘密
各種泥蛇可以棲息在淡水、聚焦揭示進(jìn)化半咸水或咸水的泥蛇沿海和內(nèi)陸地區(qū)，大多白天睡覺，研究亞神晚上大嚼魚和甲殼類動物。東南現(xiàn)在，秘蛇秘密他們也吸引了兩代庫大學(xué)的聚焦揭示進(jìn)化研究人員。
主要作者賈斯汀·伯恩斯坦(Justin Bernstein)是泥蛇深圳福田區(qū)上門（上門一條龍服務(wù)）[微信1662+044-1662][提供外圍女上門服務(wù)快速安排面到付款不收定金KU基因組學(xué)中心的博士后研究員，他進(jìn)行的研究亞神新的DNA驅(qū)動的調(diào)查是系統(tǒng)學(xué)的一個例子:研究物種如何進(jìn)化以及它們之間的關(guān)系。
它建立在1970年由Ko Ko Gyi在沒有DNA分析的東南情況下對泥蛇進(jìn)行的“不朽”研究的基礎(chǔ)上。Gyi是秘蛇秘密一位來自緬甸的有前途的進(jìn)化生物學(xué)家，他在聯(lián)合國教育、科學(xué)及文化組織為期三年的獎學(xué)金期間，在庫自然歷史博物館的兩棲爬行動物部進(jìn)行研究。
伯恩斯坦說:“我們的新論文著眼于泥蛇的進(jìn)化關(guān)系和歷史，這些蛇主要分布在南亞、東南亞、澳大利亞和新幾內(nèi)亞，但對它們的研究非常少。”“盡管幾十年的努力，包括Gyi的努力，我們對它們了解不多，因為它們很難找到。它們是喜歡泥濘環(huán)境的水棲蛇。它們是夜行動物。很少有人研究過它們的進(jìn)化。”
伯恩斯坦和他的合著者利用基因組學(xué)揭示了泥蛇的進(jìn)化史，方法是將舊博物館標(biāo)本的線粒體DNA遺傳分析與最近實地收集的新遺傳樣本相結(jié)合(這允許更高分辨率的分子分析——他們使用了每個基因組中4800個核位點的數(shù)據(jù))。
伯恩斯坦說:“如果你有一只死了幾天的動物，從那個組織中提取DNA，它會被降解——它不會是高質(zhì)量的，這會干擾我們的結(jié)果?！?br>“這意味著我們要么不能分析它，要么結(jié)果可能有點奇怪，我們不能相信它們。但是這種從自然歷史博物館的舊標(biāo)本中獲取DNA的想法在過去的十年里確實越來越多。雖然DNA被降解了，但在過去的10年里，已經(jīng)有了從自然歷史收藏中超過100年的舊標(biāo)本中獲取高質(zhì)量DNA的方案?！?br>研究人員使用來自這些博物館標(biāo)本樣本的線粒體數(shù)據(jù)來填補(bǔ)知識空白，以獲得更準(zhǔn)確的畸形科生物地理學(xué)歷史。結(jié)合最近標(biāo)本的DNA樣本，他們重建了最全面的畸形科關(guān)系家譜，顯示了哪些物種從共同的祖先分支，以及大致何時分支。
伯恩斯坦的合著者是印度科學(xué)研究所的雨果·德·索薩和卡蒂克·尚克爾；芝加哥菲爾德博物館的約翰·墨菲、哈羅德·沃利斯和薩拉·魯恩；克萊姆森大學(xué)和加州科學(xué)院的愛德華·邁爾斯；懷俄明大學(xué)和美國自然歷史博物館的肖恩·哈靈頓；以及哈佛大學(xué)生物多樣性研究所和自然歷史博物館的負(fù)責(zé)人、生態(tài)學(xué)和進(jìn)化生物學(xué)教授Rafe Brown。
“繼Gyi的開創(chuàng)性和基礎(chǔ)性工作之后，Justin已經(jīng)能夠利用一項技術(shù)突破，我們現(xiàn)在稱之為‘博物館學(xué)’——對降解的DNA進(jìn)行提取和測序，甚至是從幾十到幾百年前保存的非常古老的福爾馬林保存的標(biāo)本中提取和測序，”Brown說，他是Rutgers大學(xué)Bernstein博士委員會的“外部”成員。
“顯然，高度降解的DNA的質(zhì)量是可變的，但新的基因組測序技術(shù)、生物信息學(xué)工具和博物館生物學(xué)家的勤奮研究已經(jīng)開發(fā)出了重建一個多世紀(jì)前保存的標(biāo)本的高度片段化基因組的最佳實踐。賈斯汀成功地利用了這些新的最先進(jìn)的工具，但也帶來了他自己的研究“完整的循環(huán)”，歷史性地跟進(jìn)了Gyi的工作
這篇新論文表明，一個關(guān)于泥蛇的長期觀念是不正確的。多年來，科學(xué)家(包括伯恩斯坦)認(rèn)為，冰河期海平面的波動可能起到了“物種泵”的作用，推動了泥蛇的多樣化。事實上，許多地區(qū)的生物多樣性可以追溯到海平面的上升和下降。但是這篇新論文顯示，“更新世海平面的變化和棲息地的特殊性并不是導(dǎo)致畸形科現(xiàn)存物種豐富的主要原因?！?br>相反，伯恩斯坦和他的同事認(rèn)為，泥蛇物種豐富性更可能的驅(qū)動因素發(fā)生在大約2000萬年前的漸新世，當(dāng)時東南亞滑動的構(gòu)造板塊和移動的河流可能會在泥蛇群體之間反復(fù)切斷和重建基因流，從而推動多樣化。
伯恩斯坦說:“雖然我們永遠(yuǎn)無法證明究竟發(fā)生了什么，引發(fā)了泥蛇的多樣化，但我們可以排除或拒絕一些先前闡明的假設(shè)。”“因為我們在更新世海平面波動前1500-2000萬年發(fā)現(xiàn)了強(qiáng)有力的統(tǒng)計支持，我們需要尋找替代性的解釋，或解釋生物多樣性產(chǎn)生的新方法?！?br>伯恩斯坦和布朗很快指出了50年前吉伊對泥蛇的開創(chuàng)性工作，他的工作不僅出現(xiàn)在新的論文中，而且有幾個想法被后來的DNA測試所證實。
“Gyi在50多年前完成了一項關(guān)于這一群蛇的不朽工作，并且沒有得益于分子分析，”Brown說。
“就其本身而言，這是一項相當(dāng)大的成就——他的工作在當(dāng)時是徹底全面的，他真正利用了大多數(shù)可用的技術(shù)，例如對這一神秘蛇類群體中所有物種的頭骨進(jìn)行詳細(xì)的X射線檢查，他在1970年的專著中徹底研究了泥蛇的進(jìn)化關(guān)系‘從0到60’?！?br>“我知道他的顧問，已故的比爾·杜爾曼，在得知吉在離開古阿姆后不久就意外地在緬甸去世時，傷心欲絕。但是，即使在今天，我們?nèi)匀辉谶@里重溫和慶祝高古吉的獨特貢獻(xiàn)，他的工作由菲爾德自然歷史博物館的研究人員約翰·墨菲和哈羅德·k·沃利斯繼續(xù)進(jìn)行，現(xiàn)在由賈斯汀·伯恩斯坦繼續(xù)進(jìn)行。